최근 글에서 저는 한국이 강대국과 선진국의 갈림길에서 고민하고 있다는 이야기를 했습니다. 국가의 방향성이 부재한 상태에서 자원의 배분만 변화하는 사회는 안정적일 수는 있어도 역동적인 사회가 될 수는 없습니다. 그동안 선진국이 되자는 국가적 목표에 그 어느 누구보다도 한국인들은 충실하게 따라갔고, 마침내 이루었습니다. 이제는 그 다음을 생각할 때가 되었습니다. 하드파워를 넘어선 '질서 설계자'로서의 소프트파워 강대국이 되기 위해서는 객관적인 하드파워가 필요합니다. 제가 앞선 글에서 강조했듯 생산성이 세계의 공장으로서 기능할 만큼 높아야 하며, 에너지 자립 역시 필수적입니다. 또한 강대국은 외부에 자신의 의지를 투사할 수 있어야 합니다. 이는 지금처럼 모든 국가와 잘 지내는 것이 아니라 때로는 분쟁을 각오하..
🧐 1. 이 논문을 선택한 이유 (In Silico: '빈 잠금장치'를 만드는 설계도)우리는 보통 '잠금장치(Binding Site)'가 명확할 때 그에 맞는 '열쇠(약물)'를 찾기 위해 In silico를 씁니다. 하지만 Frizzled(FZD) 수용체는 그동안 소분자 화합물이 붙을 수 있는 주머니 자체가 어디인지조차 모르는 '난공불락'의 타겟이었습니다.이 논문은 "주머니가 없다면, 친척 모델(Smoothened)을 빌려와서 주머니를 먼저 설계하자"는 파격적인 In silico 전략을 보여줍니다. '데이터가 없어서 연구를 못 한다'는 핑계를 데이터 사이언스로 어떻게 극복하는지 보여주는 교과서적인 사례입니다. 📝 2. 논문 정보논문 제목: In silico docking yields small mol..
🧐 1. 이 논문을 선택한 이유 (In Silico: '상태'를 찾는 나침반)우리는 대개 '어떤 단백질 타겟에 어떤 약이 붙을까?'를 고민할 때 In silico를 사용합니다. 하지만 이 논문은 한 차원 더 나아갑니다. "성공적으로 재생되는 신경세포의 '상태(State)' 자체를 복제할 수 있을까?"라는 질문을 던집니다. 척수 손상(SCI) 치료의 난제를 풀기 위해, 연구진은 '특정 타겟'이 아닌 '전사체 시그니처(Transcriptional Signature)'라는 거대한 데이터의 파도를 In silico로 분석했습니다. 복잡한 생물학적 현상을 데이터 사이언스로 단순화하여 실제 치료제(Thiorphan)까지 연결해낸 이 논문의 논리 구조는 네트워크 약리학을 공부하는 우리에게 큰 영감을 줍니다. 📝..
최근 우리 사회 곳곳에서는 한국이 발전의 정점을 지나 쇠퇴의 징후를 보이고 있다는 우려 섞인 목소리가 들려옵니다. 한국전쟁이나 IMF 외환위기 같은 극단적인 고통의 시기는 아닐지라도, 우리가 지금보다 더 강력하고 번창하는 국가가 되기는 어려울 것이라는 비관적 전망에 많은 이가 동의하고 있습니다.현재 대한민국은 역사상 유례없는 강력한 군사력과 경제력이라는 하드파워, 그리고 K-Pop으로 대표되는 소프트파워를 동시에 보유하고 있음에도 불구하고, 인구 구조의 붕괴를 목격하며 정체 모를 두려움에 휩싸여 있습니다. 세계 어느 국가보다 빠른 성장을 일궈냈음에도 우리를 덮고 있는 이 어색하고도 실질적인 불안의 정체는 무엇일까요? 선진국의 달성과 강대국의 신기루 사이에서 이러한 불안의 기저에는 우리가 '선진국'과 '강..
1. 🧐 이 논문을 선택한 이유 (In Silico의 재발견)지금까지 우리는 천연물의 성분이 타겟에 붙는지 확인하는 도구로써 In silico(도킹, MDS)를 봤습니다. 하지만 이 논문은 "뇌가 어떻게 작동하는지 설명하는 이론(Normative theory)"을 만들기 위해 In silico를 사용합니다.소뇌(Cerebellum)가 운동 기억을 '피질(Cortex)'에서 '심부핵(Nuclei)'으로 옮기는 현상(System consolidation)은 오랫동안 미스터리였습니다. 연구진은 이를 생물학적 실험만으로 풀기보다, "뇌는 통계학적 오류(Bias-Variance)를 최소화하는 방향으로 설계되었을 것이다"라는 가설을 세우고, 이를 컴퓨터 모델(In silico)로 구현해 증명했습니다. NP가 아닌..
전방위적 압박 속의 침묵, 치밀하게 설계된 ‘방패’와 ‘창’ 쿠팡의 개인정보 대량 유출 사태 이후 정부의 대응은 매우 이례적입니다. 영업정지 언급은 물론, 국세청의 정밀 조사를 통한 전방위적 압박이 진행되고 있습니다. 이는 단순히 김범석 회장의 국회 불출석에 따른 감정적 대응이라기엔 그 수위가 매우 높습니다. 하지만 더 흥미로운 대목은 쿠팡의 태도입니다. 쿠팡은 신임 한국법인 대표를 전면에 내세워 책임의 화살을 분산시키는 동시에, 이전부터 20여 명 이상의 베테랑 대관 인력을 확충하며 조용한 응전 체제를 구축해 왔습니다. 국회와 정부의 거센 요구에도 '묵묵부답'으로 일관하는 것은, 이미 법적·행정적 시나리오 검토를 끝내고 장기전에 돌입했음을 시사합니다. 아킬레스건인 ‘고정 인건비’, 정부 규제를 지렛대 ..
'운'의 영역에서 '예측'의 과학으로: AI가 바꾼 연구의 기획력 복잡하게 요동치는 시대, 변화의 파고는 지식의 최전선인 대학 연구실의 풍경마저 바꿔놓고 있습니다. 과거의 연구가 연구자의 직관이나 우연한 발견에 기대어 평생을 천착하는 ‘장인형 모델’이었다면, 이제는 AI를 통한 ‘설계형 모델’로 급격히 전환되고 있습니다. 그간 연구 기획서에서 ‘탐색’이라는 단어는 자칫 근거 없는 막연함으로 치부되어 기피 대상이 되기도 했습니다. 하지만 AI 추론을 통해 수많은 변수 간의 상호작용을 미리 예측할 수 있게 된 지금, 탐색은 고도의 과학적 프로세스가 되었습니다. 미국 FDA에서 동물실험의 대안으로 오가노이드와 더불어 AI 기반의 네트워크 약리학(NAMs)을 꾸준히 언급하는 것은 이제 AI가 단순한 보조 도구를..
1. 🧐 이 논문을 선택한 이유KoGES 같은 인체 데이터와 네트워크 약리학을 붙일 수 없을까 하는 질문에서 시작했습니다. 유전체도, 네트워크 약리학도 데이터 분석 연구인데, 막상 전공 영역을 분리해서 보는 경우가 많습니다. 유전체를 대상으로 하는 두 영역의 공통분모를 이 논문이 보여줍니다.이 연구는 한국인 72,295명의 KoGES 데이터를 분석하여 고지혈증 유전자를 찾고(GWAS), 그 유전자를 조절하는 천연물을 컴퓨터로 탐색(NP & Docking)했습니다. '대규모 인체 데이터(Epidemiology)'가 '실험적 검증'을 대체할 수 있음을 보여주는, 벤치마킹의 가치가 높은 논문입니다.2. 📝 논문 정보논문 제목: Genetic Variants, Bioactive Compounds, and P..
1. 🧐 이 논문을 선택한 이유 (Q1의 자격)네트워크 약리학(NP) 논문이 쏟아져 나오면서, 단순히 "DB 검색해보니 A성분이 B타겟에 붙을 것 같다" 정도로는 좋은 저널에 가기 힘들어졌습니다.이 논문은 (1) 단일세포 전사체 분석(scRNA-seq)을 도입해 '어떤 세포'가 문제인지 정확히 짚어냈고, (2) 동물 및 세포 실험으로 예측된 기전을 완벽하게 증명했습니다. "예측(NP) + 심층 분석(Omics) + 검증(Experiment)"의 3박자를 모두 갖춘, 임팩트 팩터(IF) 높은 저널이 선호하는 전형적인 구성입니다.2. 📝 논문 정보논문 제목: Integrating single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq and network pharmacology reveals pro..
감정적 정책의 청구서: 의정 갈등이 보여주는 경제적 대가 국가 정책의 최종 결정권자는 결국 국민입니다. 굳이 헌법 1조 2항을 상기하지 않더라도, 대리인인 정치인의 손을 빌리든 국민이 직접 나서든, 정책의 추진과 그에 따른 책임은 오롯이 국민의 몫입니다. 언론을 통해 매일 쏟아지는 새로운 정책들은 막무가내인 듯싶다가도 여론의 눈치를 살피는 모양새를 취합니다. 문제는 이 복잡한 정책들을 국민이 매번 정확히 판단하기가 쉽지 않다는 점입니다. 최근의 의정 갈등만 봐도 그렇습니다. 여기에는 감정적인 대립과 복잡다단한 의료 시스템, 그리고 정치적 계산이 뒤엉켜 있습니다. 국민들은 자신의 생명을 담보로 의사들의 파업을 견디며 응급실 이용을 줄여야 했습니다. 지금은 개원가의 보장 축소가 화두입니다. "돈 잘 버는 의..